Jednou z výhradních kompetencí Celní správy ČR je kontrola výkonového zpoplatnění, tzv. mýta, na pozemních komunikacích u vozidel nad 3,5 tuny. Kontrolu elektronických dálničních známek u osobních vozidel spravují celníci společně s Policií ČR.
Na českém území je přibližně 1 588 km zpoplatněných dálnic a 1 385 km zpoplatněných silnic I. třídy. Elektronický systém mýtného a systém elektronických dálničních známek umožňují efektivní kontrolu. Mobilní hlídky mohou přímo ve svém vozidle rychle ověřit správnou úhradu mýtného, nebo zda má řidič platnou dálniční známku.
Celníci v loňském roce odhalili 19 299 případů porušení pravidel mýtného systému, což je zhruba o 2 tisíce prohřešků méně než v roce předešlém. Nejčastěji se jednalo o nesprávné nastavení počtu náprav, jízdu s nefunkční mýtnou jednotkou nebo jízdu bez úhrady mýtného. Přibližně 70 % těchto případů se týkalo zahraničních vozidel. Řidiči na pokutách dohromady uhradili necelých 32 mil. Kč. Souhrnné pokuty za jízdu bez platné elektronické dálniční známky čítaly, podobně jako loni, přes 39 mil. Kč - při 20 366 zjištěných případech porušení.
Rok 2025 byl z pohledu prodeje elektronických dálničních známek rekordní. V České republice se jich prodalo více než 10,3 milionu kusů, celkové tržby za e-známky dosáhly 8,7 miliardy korun. Vybraná částka slouží k financování údržby a rozvoje dálnic a silnic I. třídy.
Od 1. ledna 2026 činí cena roční elektronické dálniční známky 2 570 Kč, třicetidenní stojí 480 Kč, desetidenní 300 Kč a jednodenní 230 Kč. Poloviční cena platí pro vozidla s pohonem na zemní plyny (CNG a LNG) a biometan, čtvrtinová pro plug-in hybridy s emisemi CO₂ do 50 g/km. Vozidla s pohonem na elektřinu nebo vodík mohou dálnice využívat i nadále bez poplatku. Pokud řidiči nakupují dálniční známku elektronicky, měli by tak učinit přes státní e-shop edalnice.cz a dát si pozor před nákupem na portálech neoficiálních internetových prodejců.
Při kontrolní činnosti na pozemních komunikacích celní správa rovněž vybírá a vymáhá některé pokuty a poplatky, které byly uloženy jinými správními orgány, pokud nebyly dobrovolně zaplaceny. V případě neuhrazení pokuty za dopravní přestupky zabrání celníci řidiči v pokračování jízdy přiložením tzv. botičky na vozidlo, nebo odebráním registrační značky.
V roce 2025 řešila celní správa v terénu 8285 případů nedoplatků a vybrala dohromady dluhy ve výši přes 26,2 mil. Kč, což je o milion korun více než rok před tím. Jen pro zajímavost, využili při tom „bič“ v podobě 275 kusů zadržených registračních značek vozidel.
Souhrnně celníci v uplynulém roce vybrali na silnicích přibližně 71 milionů korun na pokutách a dalších více než 26 milionů korun na nedoplatcích řidičů.
