Splní-li osoba povinná značit líh nebo distributor lihu podmínky registrace, správce daně je zaregistruje. Rozhodnutí o registraci se vydává postupem podle daňového řádu, tedy do 30 dnů ode dne podání bezvadné přihlášky, nebo odstranění vad přihlášky (§ 129 daňového řádu). Ve zvlášť složitých případech může tuto lhůtu prodloužit nejblíže nadřízený správce daně.Správce daně v rozhodnutí o registraci přidělí osobě povinné značit líh registrační odběrné číslo, uvede místo značení lihu, rozsah a způsob vybavenosti sledovacím zařízením (provozovateli daňového skladu, oprávněnému příjemci nebo dovozci lihu ze třetích zemí, který má místo značení lihu také na daňovém území České republiky) a případně stanoví další technické podmínky, za nichž může být značení lihu prováděno.
Distributorovi lihu přidělí správce daně v rozhodnutí o registraci registrační distribuční číslo.
Osoba povinná značit líh a distributor lihu jsou registrováni od pátého dne následujícího po účinnosti rozhodnutí, kterým správce daně o registraci rozhodl, až do účinnosti rozhodnutí o zrušení registrace, případně do zániku registrace. Účinnosti nabývá rozhodnutí o registraci okamžikem oznámení. Oznámením se rozumí zpravidla doručení rozhodnutí (§ 101 odst. 6 daňového řádu). Rozhodnutí o registraci se neodůvodňuje, pokud správce daně rozhodne zcela v souladu s přihláškou k registraci. Proti rozhodnutí je přípustné odvolání (§ 109 odst. 1 daňového řádu). Odvolání proti rozhodnutí o registraci nemá odkladný účinek (§ 109 odst. 5 daňového řádu).
Rozhodnutí o registraci osoby povinné značit líh nebo distributora lihu namísto dosud registrované osoby povinné značit líh nebo dosud registrovaného distributora lihu správce daně vydá na základě přihlášky k registraci (uvedené v příloze č. 6 nebo 8 k vyhlášce) podané osobou, která je osobou blízkou (podle § 22 odst. 1 zákona č. 89/2012 Sb., občanský zákoník, ve znění pozdějších předpisů) dosud registrované osoby povinné značit líh nebo dosud registrovaného distributora lihu a po splnění všech podmínek pro změnu registrované osoby povinné značit líh nebo registrovaného distributora lihu stanovených v § 24a a 49a zákona o PZL. Toto rozhodnutí správce daně doručí doposud registrované osobě i nově registrované osobě. Nově registrované osobě povinné značit líh a nově registrovanému distributorovi lihu pak zůstane registrační odběrné číslo případně registrační distribuční číslo původně registrované osoby.
