Zlínští celníci vyhodnocovali výsledky své činnosti za uplynulé období. Nejde jen o tradiční výběr cla a daní, ale také činnosti, které mnohdy bezprostředně navazují, např. následné kontroly po propuštění zboží. Mezi významné kompetence, jejichž výsledky byly bilancovány, také patří činnosti v oblasti spotřebních daní, daňové kontroly, dále kontroly zaměřené na ochranu duševního vlastnictví a ochranu spotřebitele.
V první polovině roku 2016 bylo ze zboží pocházejícího z tzv. třetích zemí, tedy zemí mimo EU, vybráno clo v hodnotě 153 453 394 Kč, do státního rozpočtu byla odvedena spotřební daň ve výši 348 486 158 Kč.
V rámci kontrolních činností odboru zaměřených na oblast cel, tj. činnost oddělení Následných kontrol, bylo za 1. pololetí 2016 zaznamenáno 14 ukončených kontrol po propuštění zboží, z toho 12 kontrol s pozitivními výsledky (85% úspěšnost) s celkovou částkou doměřeného cla včetně příslušenství 3 313 000 Kč. Velmi dobrých výsledků bylo dosaženo také v rámci kontrol spadajících do agendy Intrastat (statistiky intrakomunitárního obchodu), kde bylo v daném období ukončeno 47 kontrol, z čehož 45 bylo pozitivních, tj. s 95% úspěšností.
Dalšími kontrolovanými oblastmi byl prodej nelegálního alkoholu, ochrana duševního vlastnictví a ochrana spotřebitele, u kterých nebyl dosažen významnější fiskální efekt, nicméně provedené kontroly mají značný preventivní význam.
Neméně důležitou součástí činnosti celního úřadu je výkon kompetencí v oblasti dělené správy, (tj. vymáhání a vybírání pokut, poplatků a odvodů uložených jinými správními orgány) celková částka vybraných poplatků a pokut byla ke dni 30. června tohoto roku 40 625 175 Kč.
Významných výsledků bylo také dosaženo v rámci činnosti Zlínské daňové „KOBRY", kdy společně s pracovníky finanční správy a policie se podařilo odhalit a zastavit podvody v oblasti krácení DPH v obchodech s potravinářským zbožím, u níž celková škoda na dani z přidané hodnoty činí nejméně 140 000 000 Kč. V realizovaných případech činí částka zajištěných finančních prostředků, akcií, nemovitostí a věcí movitých celkem 96 000 000 Kč.