Dne 1. 7. 2025 vznikl na základě nového organizačního uspořádáni nový Celní úřad v Plzni, který převzal působnost tří celních úřadů – Celního úřadu pro Plzeňský kraj, Celního úřadu pro Karlovarský kraj a Celního úřadu pro Jihočeský kraj. Vedení celního úřadu reprezentované ředitelem plk. Mgr. Bc. Hynkem Berkou sídlí v ulici Antonína Uxy 11, v Plzni.
Zřízení celního úřadu je součástí rozsáhlé transformace Celní správy České republiky, vycházející ze strategie Generálního ředitelství cel pro období let 2023–2026. Ta reaguje mimo jiné na potřebu zvýšení efektivity, úsporná opatření, snížení administrativní zátěže podnikatelů a posílení moderního řízení veřejné správy. Dnešní struktura vykonávaných správních a právních procesů je již z více než devadesáti procent elektronizována.
Transformace Celní správy České republiky se v první fázi opírá o novelu zákona
č. 349/2023 Sb., kterou se mění některé zákony v souvislosti s konsolidací veřejných rozpočtů. Na základě této legislativní změny zaniklo ke dni 30. června 2025 patnáct stávajících celních úřadů a od 1. července je nahradilo šest nástupnických, kdy jedním z nich je právě Celní úřad v Plzni. Cílem druhé části reformy je provedení organizačně-kompetenčních změn v právních předpisech upravujících působnost celní správy.
Nově vzniklý celní úřad bude nadále pokračovat ve výkonu širokého spektra činností v oblastech celnictví z pohledu letecké přepravy cestujících, letecké i pozemní přepravy obchodního zboží, přepravy poštovních zásilek, správy spotřebních daní, dohledu nad pohybem zboží, výkonu správních činností a dalších významných kompetencí s využitím digitálních nástrojů a online služeb, které usnadňují komunikaci a správu celních agend.
Pracoviště plzeňského celního úřadu jsou rozmístěna v Plzni na adresách Antonína Uxy 11, Radobyčická 25 a Domažlická 176. V Karlových Varech na adresách Dubová 8 a K Letišti 132. Další pracoviště se nachází v Českých Budějovicích na adresách Kasárenská 6 a Vrbenská 8, v Jindřichově Hradci na adrese Česká 1284/II a v Plané nad Lužnicí na adrese ČSLA 23.
