Celní úřad zruší registraci na návrh distributora pohonných hmot (§ 6l zákona o PHM).Celní úřad zruší registraci z moci úřední v případech uvedených v § 6m odst. 2 zákona o PHM. Pokud nejsou splněny podmínky registrace a pokud povaha nesplněných podmínek splnění na výzvu připouští a nehrozí nebezpečí z prodlení, vyzve celní úřad distributora pohonných hmot k jejich splnění v jím stanovené lhůtě (§ 6m odst. 1 zákona o PHM), přičemž současně zahájí řízení o zrušení registrace. Pokud přes výzvu nedojde ve stanovené lhůtě ke splnění podmínek registrace, celní úřad registraci zruší. Pokud ve stanovené lhůtě dojde ke splnění podmínek registrace, celní úřad řízení o zrušení registrace zastaví.
Pokud byla zrušena registrace z moci úřední, může podle § 6m odst. 3 zákona o PHM distributor pohonných hmot podat přihlášku k registraci nejdříve po uplynutí 3 let ode dne, kdy rozhodnutí o zrušení registrace nabylo právní moci, nejedná-li se o zrušení registrace podle § 6m odst. 2 písm. e) zákona o PHM.
Pokud byla zrušena registrace na návrh distributora pohonných hmot nebo z moci úřední podle § 6m odst. 2 písm. e) zákona o PHM, může distributor pohonných hmot podat novou přihlášku k registraci kdykoliv.
